يعمل الدكتور مدحت نافع مستشاراً لوزير التموين والتجارة الداخلية المصري، ومحاضراً للاقتصاد والتمويل بكلية الاقتصاد والعلوم السياسية بجامعتي القاهرة والمستقبل، وكبير خبراء بأحد المشروعات الممولة من الاتحاد الأوروبي في مجال تمويل تحول الطاقة.

وقد سبق له تقلّد العديد من المناصب الحكومية وغير الحكومية في مصر وخارجها أبرزها مساعد وزير التموين والتجارة الداخلية لأعمال تطوير الشركات، ورئيس مجلس إدارة الشركة القابضة للصناعات المعدنية، ورئيس مجلس إدارة معهد التبين للدراسات المعدنية (بدرجة رئيس جامعة) ونائب رئيس مجموعة عمل الاستدامة بالاتحاد العالمى للبورصات، ومشرف على الإدارة المركزية لتمويل الشركات بالهيئة العامة للرقابة المالية المصرية، وعضو اللجنة التنفيذية العليا، ومدير عام إدارة المخاطر وإدارة الرقابة على التداول والمؤشرات ومشرف على مركز المعلومات بالبورصة المصرية، وخبير بالمحاكم الاقتصادية، ومحلل نظم بسلطنة عمان.

كما يتمتع بعضوية مجالس إدارات متعددة أبرزها مجلس إدارة مدينة دمياط للأثاث، والمركز القومى للبحوث الاجتماعية والجنائية، وكل من مركز بحوث وتطوير الفلزات، وشركة حلوان للأسمدة، ومجلس كلية إدارة الأعمال بجامعة مصر الدولية سابقاً.

وقد حصل الدكتور نافع على درجة الدكتوراه فى فلسفة علم الاقتصاد من كلية الاقتصاد والعلوم السياسية، جامعة القاهرة وله العديد من المؤلفات المنشورة من كتب ومقالات وأوراق بحثية ودراسات، وله مقال أسبوعي فى جريدة الشروق المصرية ولقاءات تلفزيونية متعددة.